Pro informační systémy se snažíme použít to nejlepší, co softwarový trh nabízí. To platí především pro databázi, která je srdcem celého IS a na jejíž rychlosti, schopnostech a stabilitě závisí úspěšný vývoj i provoz celého produktu.
Na základě svých zkušeností preferujeme databáze z rodiny Oracle 10g a 11g, které nabízejí jak free distribuce (10g Express Edition) vhodné pro malé projekty, tak profesionální komerční řešení, jejichž pomocí lze zvládnout i ta nejnáročnější zadání.
V závislosti na specifických požadavcích však může být užito i jiných databázových serverů, jako je MySQL nebo PostgreSQL, případně Microsoft SQL Server.